3分2区蛋白质组学文章怎么写?

低成本小投入3分二区蛋白质组学文章!

随着转录组测序类文章的发文难度不断提高,越来越多的课题组开始了蛋白质组学方面的研究,其中尤以TMT/iTRAQ火热。那么,蛋白质组学类文章该如何撰写呢?好发么?在这里,小编给大家带来一篇今年9月份发表在BMC Plant Biology上的蛋白质组学文章。

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材料方法

1、水稻黑条矮缩病毒RBSDV感染玉米幼苗作为感染组,另有健康玉米幼苗作为对照组,随机选取5株幼苗作为一个生物学重复。感染组和对照组各3个生物学重复,共6个样品;

2、针对RBSDVS6区段设计引物,用于RBSDV拷贝数的测定;

3、TMT标记;

4、蛋白质进行GOKEGG注释;

5、QRT-PCR验证。

结果分析

1、共鉴定出7615种蛋白质,其中6319种蛋白可以定量,并进行了GO、KEGG、功能域预测、亚细胞定位等分析;

2、通过差异分析鉴定了116个差异蛋白DAPs,其中35个上调,81个下调;

3、对鉴定出来的所有蛋白进行GO分析和亚细胞定位分析;

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4、对差异蛋白进行富集分析,包括GO、KEGG富集分析;

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5、分析发现,15个显著上调或下调的蛋白涉及6个代谢通路;

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6、挑选了6个关键的RBSDV应答基因进行qRT-PCR验证。

最后结合前人的研究和自己的结论进行讨论,并展望;一篇3.930分的二区文章就完成了。

总的来说,这篇文章思路清晰,设计简单,没有什么复杂的实验,值得初学者借鉴。

另外,蛋白质组学分析有一些基本的知识点,大家可以在我们组学大讲堂问答社区(www.omicsclass.com.cn)进行问题搜索。

需要文章原文的老师请关注组学大讲堂微信公众号,转发该文章至您的朋友圈并截图,然后在公众号对话框内发送截图证明并留言 玉米蛋白质组” 即可获得原文献!(注意关键词需写全)。

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