graphpad prism绘图时,Y轴的缺口设置

绘制柱状图,Y周断裂方法设置

做基因表达量的时候,由于相同的基因在不同的样品中的表达量差异很大,如果我们用柱状图绘制,就会出现以下图像:

高表达量的基因太高,导致低表达量的基因几乎显示不出来:


attachments-2018-09-Zo4J92Wr5b9f6d45261f6.jpg

这里我们可以利用graphpad的,Y轴断裂方法来使低表达量的基因也能显示高低变化如下所示:

attachments-2018-09-2G4LBzoh5b9f6cf84b68a.jpg

具体的操作方法:

1、双击Y轴,选择“Two segments”;

2、“Range”里面的length百分比是你希望Y轴分段的比例,默认50%,也就是在中间断开。


attachments-2018-09-zfKlw0PY5b9f6f676ab6a.jpg

3、minimum和maximum是Y轴较小区段你所设置的区间数值。设置完毕,点ok。

attachments-2018-09-1AaPydmb5b9f6f8211f05.jpg

4、此时你的图Y轴已经发生变化,双击下面Y轴区段的直线(上面的Y轴直线),在minimum和maximum里继续设置你所要的区间数值,点ok,同样的道理在设置Y轴的上半段,设置一下就好,如下:

attachments-2018-09-YOolp7lK5b9f6fb6ef3f3.jpg

5、当然,你还可以进行其他的设置,分三段等等。


更多生物信息课程:

1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程基因家族文献思路解读

2. 转录组数据理解不深入?图表看不懂?点击链接学习深入解读数据结果文件,学习链接:转录组(有参)结果解读转录组(无参)结果解读

3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA,提升你的文章档次,学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析

4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘转录组文献解读

5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读OTU网络图绘制cytoscape与网络图绘制课程

6. 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用biolinux搭建生物信息分析环境linux命令处理生物大数据perl入门到精通perl语言高级R语言画图R语言快速入门与提高

7. 医学相关数据挖掘课程,不用做实验也能发文章:TCGA-差异基因分析GEO芯片数据挖掘 GEO芯片数据不同平台标准化 、GSEA富集分析课程TCGA临床数据生存分析TCGA-转录因子分析TCGA-ceRNA调控网络分析

8.其他,二代测序转录组数据自主分析NCBI数据上传二代fastq测序数据解读

  • 发表于 2018-09-17 17:05
  • 阅读 ( 35587 )
  • 分类:软件工具

0 条评论

请先 登录 后评论
omicsgene
omicsgene

生物信息

654 篇文章

作家榜 »

  1. omicsgene 654 文章
  2. 安生水 325 文章
  3. Daitoue 167 文章
  4. 生物女学霸 120 文章
  5. 红橙子 78 文章
  6. CORNERSTONE 72 文章
  7. rzx 67 文章
  8. xun 66 文章